En el año 1987 los directivos y socios del programa de vivienda el Álamo II Etapa – Vipol – Comas dona una extensión del área total de terreno de 16, 405,28 m², área útil 12, 919.28 m² ubicada en la Mz. “E” Lt. “1” de la Cooperativa de Vivienda Policial Ltda.. Nº 158 VIPOL, del distrito de Comas, Provincia y Departamento de Lima. En Agosto de 1997, se propone alternativas de nombres para la creación de la I.E., resultando ganador el nombre de "HÉROES DEL ALTO CENEPA" como justo reconocimiento a los soldados peruanos que ofrendaron sus vida en el campo de batalla en defensa de nuestra soberanía Nacional, en el conflicto armado con el vecino país del Norte. Con fecha 31 de octubre de 1997, la Directora del programa Sectorial II UGEL 04 Prof. Juana Iris Cuadros de Salas, expide la R.D. Nº 002256-97, por la cual se crea el nivel de Educación Primaria de Menores Nº 8181. Así mismo, el nivel Secundaria de Menores que lleva el nombre de "HÉROES DEL ALTO CENEPA", de variante Científico Humanístico. En el año 2000, se inicio el funcionamiento de la I.E. en el local comunal de la Cooperativa de Vivienda siendo su directora la prof. JUANA CAYETANO PÉREZ, con el nivel de Educación secundaria en el 1º y 2º año. En el año 2001 se apertura el nivel primaria del 1º al 6º grado, comienza a ser realidad el funcionamiento de la I.E. en su área de terreno, con la instalación de tres módulos de material pre-fabricado, para el funcionamiento completo de educación Primaria y los tres primeros años del nivel Secundaria, continuando en la Dirección de la I.E. la prof. JUANA CAYETANO PÉREZ. A partir del 02 de enero del 2002, asume la dirección de la I.E. en calidad de Director Titular el Lic. FRANK LÓPEZ SOTELO. A partir del Año Escolar 2002 se amplia el servicio educativo en Educación Secundaria del 1º al 5º año. Asimismo, se lleva a cabo la construcción de los SS.HH. siendo financiada por la UGEL N° 04 siendo su directora la prof. GOÑI. Durante el año 2005, asume la encargatura de la Dirección de la I.E. la prof. Enriqueta ESCAJADILLO QUISPE, por destaque del Director titular a otra I.E. Durante el año 2008 se implementa el Aula de Innovación Pedagógica (AIP) con el servicio de INTERNET por parte del MED. El año 2009 se concluye la construcción del cerco perimétrico del plantel, la misma que se inicio el año 2003 con el apoyo del personal docente, administrativo, padres de familia. En el 2012 se implementa la Biblioteca la Biblioteca de la I.E. con el apoyo de la Empresa Camargo